自动化深度学习框架助力空间肿瘤生物标志物发现
从“几重”到“200多重",单细胞空间蛋白组学正在经历指数级进化,我们终于可以在单张组织切片上"看见"整个肿瘤免疫微环境的全貌。但如何让每个信号都经得起病理学家推敲,让每一轮染色都稳如初见,让发现端的惊艳真正走到临床端的价值?
今年AACR会议期间,我们发布过一组硬数据:CellScape™ XR 单细胞原位空间蛋白质组学平台在单张FFPE切片突破208重靶标检测,覆盖12种人类肿瘤及正常FFPE组织样本,全景解析肿瘤免疫微环境。(回顾:【2026AACR速递】「挑战不可能」突破200重!CellScape™XR重新定义原位蛋白质成像新高度)
10月15日,Bruker Spatial Biology联合Schleswig-Holstein大学医院(UKSH)病理科Niclas Blessin团队举办一场线上研讨会,分享这套数据背后“抗体验证+深度学习+转化路径”的宝贵经验及最新进展。
Niclas Blessin及其团队,采用搭载EpicIF技术的CellScape平台,进行了单次实验多达208重靶标的免疫荧光检测。这套含有208重靶标的panel检测同时覆盖蛋白与RNA靶标,涵盖肿瘤分化、免疫表型、检查点通路、细胞增殖、信号传导、代谢、血管生成以及干细胞特性相关标志物。 研究采用的组织芯片由1040名患者的样本构建,包含50种不同正常组织,以及50余种良性、恶性组织,涉及各类癌种、淋巴瘤以及其他人类肿瘤组织。
讲座中您将了解到:
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采用EpicIF技术的CellScape平台的循环染色与温和信号清除工作流,可实现50轮以上循环染色成像周期下高重现性的生物标志物检测,同时保留组织完整度与抗原表位稳定性。
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该技术方案搭建起可规模化的技术路径,实现从生物标志物发现,到预后及转化肿瘤学检测方法开发。
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CellScape 的高维空间生物学能力,能够加速多重预后检测方法的发现、验证与后续开发;这类检测可实现患者分层、助力转化研究,并为癌症生物学带来全新认知。
讲座内容:
13:30-14:15
CellScape XR 单细胞原位空间蛋白质组学与表型分析系统技术进展
梁雪, Bruker Spatial Biology(BSB)资深应用科学家
14:15-15:15
Spatial Cancer Biomarker Discovery with an Automated Deep Learning-Based Framework
Niclas Blessin, Department of Pathology • University Hospital Schleswig-Holstein (UKSH), Campus Kiel
15:15-15:30
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